Data Science e Bioinformatica
Il corso si articola in tre parti fondamentali: una prima come introduzione generale alla componente โbioโ della bioinformatica, una seconda parte verranno affrontati i dati, una terza parteanalizzeremo dei dati della trascrittomica
Panoramica
Il corso si articola in tre parti fondamentali: una prima parte, come introduzione generale alla componente โbioโ della bioinformatica, nella quale i processi biologici piรน importanti verranno spiegati per meglio comprendere come si possano analizzare i dati che li descrivono.
Nella seconda parte verranno affrontati i dati: con quali tecnologie si generano, che struttura hanno, che impatto hanno su disco e quali infrastrutture computazionali sono necessarie per poterli conservare e analizzare.
Nella terza parte del corso, utilizzeremo un approccio piรน pratico e analizzeremo dei dati della trascrittomica, coprendo le basi statistiche, metodologiche e di workflow necessarie in un ambiente computazionale basato su R.
Il corso si concluderร con alcune brevi note di prospettiva sul collegamento fra la trascrittomica e il deep-learning.
Cosa Imparerai nel corso?
Questo corso ha lo scopo di introdurre i partecipanti alla bioinformatica, una area interdisciplinare che interseca la biologia e la genomica con le scienze dellโinformazione, la statistica e la matematica per usare e costruire strumenti e metodi computazionali allo scopo di rispondere a domande fondamentali della biologia.
Struttura delle lezioni
Deep Learning Italia struttura le sue lezioni in maniera molto semplice: allโinterno di ogni sezione ci sono video esplicativi, in cui il docente spiega la lezione, corredati da slides.
Il percorso di apprendimento solitamente รจ intervallato da test a risposta multipla e esercizi pratici che permettono di monitorare la comprensione degli argomenti di studio.
Chi puรฒ seguire il corso?
Chi ha una mente aperta e predisposta allโanalisi: le lezioni sono adatte a chiunque ma รจ necessario avere passione per i numeri e i calcoli, oltre che tanta pazienza.
Chi lavora anche full time: se sei un lavoratore full time non ti preoccupare! Potrai seguire le lezioni in completa autonomia nel tuo tempo libero.
Chi vuole crescere professionalmente: Se vuoi elevare la tua carriera Deep Learning Italia ti da lโopportunitร di poterlo fare a costi contenuti.
Programma
La Bioinformatica
- Introduzione
Il Bio della Bioinformatica
- Organizzazione e struttura di un genoma
- Varianti genetiche
- Trascrizione
- Visualizzazione di un genoma: genome browsers
- Annotazione
- Quiz
Generazione e struttura dei dati
- Next generation sequencing: short reads
- Next generation sequencing: long reads
- Sequenze e allineamenti
- Formato dei files
- Dimensioni dei dati e disk footprint & Requisiti computazionali delle
-omiche - Quiz
Analisi dei dati e caratteristiche datasets: trascrittomica
- Trascrittomica: distribuzione dati e statistica
- Trascrittomica: ambienti e software
- Trascrittomica: metodi e dati intermedi (1)
- Trascrittomica: metodi e dati intermedi (2)
- Trascrittomica: metodi e dati intermedi (3)
- Quiz
Deep learning e trascrittomica
- Prospettive
Certificato
Docenti
Francesco Lescai รจ Professore Associato di Bioinformatica, ed รจ responsabile del Laboratorio di Genomica Computazionale al Dipartimento di Biologia e Biotecnologie dellโUniversitร di Pavia. Ha una Laurea in Biotecnologie Mediche e un Dottorato in Patologia Sperimentale. Ha sviluppato un expertise in Bioinformatica, Genomica e Statistica Genetica.
Francesco ha lavorato presso lo University College di Londra, dove ha sviluppato alcune fra le prime pipeline di analisi dati per la UCL Genomics, ed ha successivamente guidato la bioinformatica al Centro di Genomica Translazionale, una partnership tra lo UCL Institute of Child Health e il Great Ormond Street Hospital, il piรน grande ospedale pediatrico dโEuropa.
ร stato chiamato successivamente ad Aarhus come Professore Associato in Genomica e Bioinformatica, dove ha guidato le analisi sulla malattia Bipolare e la Schizofrenia nel consorzio iPSYCH. Ha lavorato per QIAGEN Bioinformatics, come membro del Global Product Management Team del portfolio di CLC. Prima di spostarsi a Pavia, รจ stato Direttore della Bioinformatica per MHRA, lโAgenzia del Farmaco Inglese, presso il National Centre for Biological Standards and Control a Londra.
Vantaggi
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Puoi seguire il corso dove e quando vuoi: Deep Learning, infatti, ti offre lโopportunitร di accedere alla piattaforma in qualsiasi momento tu abbia voglia e possibilitร di studiare. Basta semplicemente un dispositivo elettronico e una connessione internet!
Troverai sempre materiale nuovo e lezioni aggiornate: i nostri professori ti forniranno moltissimo materiale per supportare i tuoi studi e aggiorneranno periodicamente la piattaforma con nuove slides o con nuovi moduli;
Nei nostri corsi troverai sempre una componente interattiva per stimolare lโapprendimento: giochi, quiz, podcast e tanto altro ti aiuteranno a migliorare e a rendere la tua formazione unica;
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Non sarai mai solo! Avrai a disposizione la nostra community per metterti in contatto con altri studenti.
A fine percorso riceverai una certificazione che potrai aggiungere al tuo CV e che ti darร la possibilitร di farti notare da grandi aziende del settore;
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