Data Science e Bioinformatica
Questo corso ha lo scopo di introdurre i partecipanti alla bioinformatica, una area interdisciplinare che interseca la biologia e la genomica con le scienze dell’informazione, la statistica e la matematica per usare e costruire strumenti e metodi computazionali allo scopo di rispondere a domande fondamentali della biologia.
Il corso si articola in tre parti fondamentali: una prima parte, come introduzione generale alla componente “bio” della bioinformatica, nella quale i processi biologici più importanti verranno spiegati per meglio comprendere come si possano analizzare i dati che li descrivono.
Nella seconda parte verranno affrontati i dati: con quali tecnologie si generano, che struttura hanno, che impatto hanno su disco e quali infrastrutture computazionali sono necessarie per poterli conservare e analizzare.
Nella terza parte del corso, utilizzeremo un approccio piu pratico e analizzeremo dei dati della trascrittomica, coprendo le basi statistiche, metodologiche e di workflow necessarie in un ambiente computazionale basato su R.
Il corso si concluderà con alcune brevi note di prospettiva sul collegamento fra la trascrittomica e il deep-learning.
Questo corso ha lo scopo di introdurre i partecipanti alla bioinformatica, una area interdisciplinare che interseca la biologia e la genomica con le scienze dell’informazione, la statistica e la matematica per usare e costruire strumenti e metodi computazionali allo scopo di rispondere a domande fondamentali della biologia.
Deep Learning Italia struttura le sue lezioni in maniera molto semplice: all’interno di ogni sezione ci sono video esplicativi, in cui il docente spiega la lezione, corredati da slides.
Il percorso di apprendimento solitamente è intervallato da test a risposta multipla e esercizi pratici che permettono di monitorare la comprensione degli argomenti di studio.
Chi ha una mente aperta e predisposta all’analisi: le lezioni sono adatte a chiunque ma è necessario avere passione per i numeri e i calcoli, oltre che tanta pazienza.
Chi lavora anche full time: se sei un lavoratore full time non ti preoccupare! Potrai seguire le lezioni in completa autonomia nel tuo tempo libero.
Chi vuole crescere professionalmente: Se vuoi elevare la tua carriera Deep Learning Italia ti da l’opportunità di poterlo fare a costi contenuti.
La Bioinformatica
- Introduzione
Il Bio della Bioinformatica
- Organizzazione e struttura di un genoma
- Varianti genetiche
- Trascrizione
- Visualizzazione di un genoma: genome browsers
- Annotazione
- Quiz
Generazione e struttura dei dati
- Next generation sequencing: short reads
- Next generation sequencing: long reads
- Sequenze e allineamenti
- Formato dei files
- Dimensioni dei dati e disk footprint & Requisiti computazionali delle
-omiche - Quiz
Analisi dei dati e caratteristiche datasets: trascrittomica
- Trascrittomica: distribuzione dati e statistica
- Trascrittomica: ambienti e software
- Trascrittomica: metodi e dati intermedi (1)
- Trascrittomica: metodi e dati intermedi (2)
- Trascrittomica: metodi e dati intermedi (3)
- Quiz
Deep learning e trascrittomica
- Prospettive
Certificato
Descrizione Docenti
Francesco Lescai è Professore Associato di Bioinformatica, ed è responsabile del Laboratorio di Genomica Computazionale al Dipartimento di Biologia e Biotecnologie dell’Università di Pavia. Ha una Laurea in Biotecnologie Mediche e un Dottorato in Patologia Sperimentale. Ha sviluppato un expertise in Bioinformatica, Genomica e Statistica Genetica.
Francesco ha lavorato presso lo University College di Londra, dove ha sviluppato alcune fra le prime pipeline di analisi dati per la UCL Genomics, ed ha successivamente guidato la bioinformatica al Centro di Genomica Translazionale, una partnership tra lo UCL Institute of Child Health e il Great Ormond Street Hospital, il più grande ospedale pediatrico d’Europa.
È stato chiamato successivamente ad Aarhus come Professore Associato in Genomica e Bioinformatica, dove ha guidato le analisi sulla malattia Bipolare e la Schizofrenia nel consorzio iPSYCH. Ha lavorato per QIAGEN Bioinformatics, come membro del Global Product Management Team del portfolio di CLC. Prima di spostarsi a Pavia, è stato Direttore della Bioinformatica per MHRA, l’Agenzia del Farmaco Inglese, presso il National Centre for Biological Standards and Control a Londra.
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Non sarai mai solo! Avrai a disposizione la nostra community per metterti in contatto con altri studenti.
A fine percorso riceverai una certificazione che potrai aggiungere al tuo CV e che ti darà la possibilità di farti notare da grandi aziende del settore;
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- Accesso al corso life long
