Introduzione alla bioinformatica
Che cos'è la bioinformatica?
La bioinformatica è un’area di ricerca interdisciplinare all’interfaccia tra scienze biologiche e computazionali.
Anche se il termine Bioinformatica non è ben definito, si può dire che questo campo scientifico si occupa della gestione computazionale di tutti i tipi di informazioni biologiche molecolari.
La maggior parte del lavoro di bioinformatica si occupa dell’analisi dei dati biologici o dell’organizzazione delle informazioni biologiche.
Come conseguenza della grande quantità di dati prodotti nel campo della biologia molecolare, la maggior parte degli attuali progetti bioinformatici si occupa degli aspetti strutturali e funzionali di geni e proteine.
Comprensione della bioinformatica e della biologia computazionale.
Secondo le definizioni del NIH :
Bioinformatica: Ricerca, sviluppo o applicazione di strumenti e approcci computazionali per espandere l’uso di dati biologici, medici, comportamentali o sanitari, compresi quelli per acquisire, memorizzare, organizzare, archiviare, analizzare o visualizzare tali dati.
Biologia computazionale: Lo sviluppo e l’applicazione di metodi teorici e di analisi dei dati, di tecniche di modellazione matematica e di simulazione computazionale allo studio dei sistemi biologici, comportamentali e sociali.
Perché la bioinformatica è un settore così caldo?
Una risposta a questa domanda è che è legata al progetto genoma umano, che ha generato un grande interesse popolare.
I vari progressi nelle tecniche di biologia molecolare (come il sequenziamento del genoma e i microarray) hanno portato a una grande quantità di dati che devono essere analizzati.
La bioinformatica può portare a scoperte importanti e aiutare le aziende a risparmiare tempo e denaro nel lungo periodo.
Una delle ragioni principali per cui la bioinformatica è un campo caldo è il vecchio adagio della domanda e dell’offerta. Ci sono troppo poche persone adeguatamente formate sia in biologia che in informatica per risolvere i problemi che i biologi hanno bisogno di risolvere.
Obiettivi della bioinformatica
- In primo luogo, nella sua forma più semplice, la bioinformatica organizza i dati in modo da consentire ai ricercatori di accedere alle informazioni esistenti e di presentare nuove voci man mano che vengono prodotte, ad esempio la Protein Data Bank per le strutture macromolecolari 3D.
- Sebbene la conservazione dei dati sia un compito essenziale, le informazioni immagazzinate in queste banche dati sono essenzialmente inutili finché non vengono analizzate. Lo scopo del secondo obiettivo è quindi quello di sviluppare strumenti e risorse che aiutino l’analisi dei dati.
- Il terzo obiettivo è utilizzare questi strumenti per analizzare i dati e interpretare i risultati in modo biologicamente significativo.
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Reference
- Introduction to Bioinformatics T.K. Attwood and Parry Smith
- Introduction to Bioinformatics Arthur M. Lesk
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